為遏止跨境侵權活動，香港海關與廣東海關不時舉行同步執法行動，在海、陸路各口岸加強堵截走私侵權貨物，並在有需要時向對方提供即時動態線報，以截查可疑車輛及旅客。同步執法行動自1996年展開以來，迄今已進行近五十次，行動中雙方在各自管轄範圍內破獲多宗侵權案件，成效顯著。雙方會繼續加強這方面的合作。
隨著內地和香港的經貿關係日益緊密，跨境物流人流日趨頻繁，兩地海關的執法及互助合作亦日趨密切，加強兩地海關人員的交流及相互培訓，成為內地與香港合作的重要項目之一。
香港海關和廣東海關每年均為對方舉辦培訓課程，讓學員更了解對方的工作範圍及模式，有利日後進一步拓展合作空間。
培訓課程 ／ 交流項目包括下列範疇：